登封市卫生防疫站是政府设置的实施我市疾病预防控制和公共卫生技术管理与服务的公益性事业单位。是全市突发公共卫生事件应急处置、疫情报告与相关因素信息管理、疾病监测、疾病防治研究、疾病预防与控制、卫生监督与监测、卫生宣传与教育、卫生防疫培训与技术指导的专业机构，为正科级事业单位，经费实行财政补助收入管理。2011年，站内共设置科室18个，其中行政管理科室5个，业务科室13个。共有干部职工148人，其中在编干部职工77人（男职工53人，女职工24人；财政开支34人，自收自支43人），离退休人员34人，临时、协管人员37人；各类专业技术人员51人（其中中级专业技术职务11人，初级专业技术职务38人），占在职职工总数的68%；行政管理人员4人，其中副科级以上领导干部4人（包括协理员2人）；中层干部19人；各类工勤人员23人。
    近几年来，登封市卫生防疫站立足经济社会发展大局，秉承“预防为主，防治结合”的卫生工作方针，坚持科学发展，规范管理，不断完善基础建设和人才队伍建设，不断提升突发公共卫生事件应急处置能力，全力做好疫情防控和卫生监督、执法工作，确保全市社会稳定和人民群众身体健康。1996年12月，被国家卫生部授予“县（市）级一等卫生防疫站”；2002年5月，被河南省爱国卫生运动委员会授予“省级卫生单位”；2003年6月，被郑州市市委、市政府授予“市级文明单位”；2010年元月，被河南省疾病预防控制中心授予“全省疾控工作先进集体”和“全省艾滋病防治工作先进集体”等荣誉称号。2011年初，防疫站在国家科技重大专项《我国传染病实验室监测技术平台的建立和病原谱监测研究》—“细菌性传染病病原谱流行规律及变异”研究课题中，成绩突出，被中国疾病预防控制中心传染病预防控制所评为先进集体。
    目前，登封市卫生防疫已逐步成为专业门类基本齐全、工作布局基本合理、应对突发公共卫生事件快速敏捷的县（市）级卫生防疫机构。